Todos os estudantes de Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Física da UFPE recebem bolsas de estudo da CAPES, CNPq ou FACEPE (agência estadual), de acordo com as normas e regulamentações de cada agência.

Em agosto de 2013, o Programa contava com 94 bolsas, sendo 46 de Mestrado (15 da CAPES, 23 do CNPq e 8 da FACEPE) e 48 bolsas de Doutorado (16 da CAPES, 29 do CNPq e 3 da FACEPE).